10. MPIクラスターを作ろう！ - NFSクライアント設定
前回からのつづきです。
9. MPIクラスターを作ろう！ - NFSサーバーをたてよう - 電子計算記
nfs-serverというマシン名で、共有ストレージのNFSサーバーを用意しました。
次にcomputeのマシンをクライアントとして、NFSマウントします。
NFSのクライアントをインストールします。
root@compute-1:~# apt update root@compute-1:~# apt install nfs-common -y
次に、マウント先を/nfsとして、fstabに設定を入れます。
root@compute-1:~# mkdir /nfs root@compute-1:~# echo "nfs-server:/nfs /nfs nfs defaults 0 0" >> /etc/fstab root@compute-1:~# mount -a root@compute-1:~# df -h Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on udev 471M 0 471M 0% /dev tmpfs 98M 4.4M 94M 5% /run /dev/sda1 15G 1.9G 12G 14% / tmpfs 488M 0 488M 0% /dev/shm tmpfs 5.0M 0 5.0M 0% /run/lock tmpfs 488M 0 488M 0% /sys/fs/cgroup nfs-server:/nfs 9.8G 23M 9.2G 1% /nfs
/nfsとしてマウントできていればOKです。
念の為、マウント先でファイルの読み書きもできるか確認しておくと間違いないですね。
root@compute-1:~# su - mpiuser mpiuser@compute-1:~$ cd /nfs mpiuser@compute-1:/nfs$ echo a > ./a mpiuser@compute-1:/nfs$ cat ./a a mpiuser@compute-1:/nfs$ rm ./a
あとは同じように、compute-2以降も設定をいれていくのですが、台数が多くて面倒なら既存のマシンは消して、compute-1をテンプレートにして、再度作成するのも良いと思います。
では、試しにHello WorldをNFSサーバー上に移動して動かしてみましょう。
mpiuser@compute-1:~$ cp -a ~/hello /nfs/ mpiuser@compute-1:~$ mpirun -np 4 --hostfile ~/my_hosts /nfs/hello/a.out Hello, world, I am 0 of 4 from compute-1 Hello, world, I am 1 of 4 from compute-2 Hello, world, I am 2 of 4 from compute-3 Hello, world, I am 3 of 4 from compute-4
以上です、では次回はHPCベンチマークの定番、姫野ベンチのMPI版を動かしてみましょう。
