電子計算記

個人的な検証を

2018-01-01から1年間の記事一覧

17. MPIクラスターを作ろう! - STREAMでハイブリッド並列を試す

前回からのつづきです。 16. MPIクラスターを作ろう! - HPLのパラメータを検討 - 電子計算記忘れてましたが、アドカレのコマ埋めの話のためにはじめたので、今回が最終回です。1ヶ月以上かかってしまいましたが。。。 今回はSTREAMをやります。HPC問わず定…

16. MPIクラスターを作ろう! - HPLのパラメータを検討

前回からのつづきです。 15. MPIクラスターを作ろう! - HPLを動かしてみる - 電子計算記前回実行したテストでは、4.915e-02GFLOPSつまり0.05GFLOPSであり、S1を1ノードだとしてもだいぶ遅い結果です。 ここからスコアをあげていくにはパラメータのチューニ…

15. MPIクラスターを作ろう! - HPLを動かしてみる

前回からの続き 14. MPIクラスターを作ろう! - qn24bを動かしてみる - 電子計算記スパコンと言えばTOP500!Home | TOP500 Supercomputer SitesTOP500と言えばLinpack!LINPACK - Wikipediaということで、LinpackのMPIによる並列実装のHPLを動かしてTOP500の…

14. MPIクラスターを作ろう! - qn24bを動かしてみる

前回からのつづきです。 13. MPIクラスターを作ろう! - 姫野ベンチをもう少し動かしてみる - 電子計算記前回までの姫野ベンチはちょっと難しかったので、もっと簡単にノードを増やすとスケールするのがわかるようなベンチマークを動かしてみましょう。とい…

13. MPIクラスターを作ろう! - 姫野ベンチをもう少し動かしてみる

前回からのつづきです。 12. MPIクラスターを作ろう! - 姫野ベンチを今度こそ動かす - 電子計算記姫野ベンチ難しいですね。 前回は C + MPI, static allocate version を使ってましたが、 今回は Fortran90 + MPI をやってみましょう。これまでのインストー…

12. MPIクラスターを作ろう! - 姫野ベンチを今度こそ動かす

前回からのつづきです。 11. MPIクラスターを作ろう! - 姫野ベンチを動かす - 電子計算記簡単だろうとはじめた姫野ベンチですが結構難しいものですね。 CPUクロックが可変だと計測時間がえらく長くなってしまったり、計測値が怪しくなる課題について2つのア…

11. MPIクラスターを作ろう! - 姫野ベンチを動かす

前回からのつづきです。 10. MPIクラスターを作ろう! - NFSクライアント設定 - 電子計算記NFSストレージサーバーが用意できたので、MPIクラスター環境として最低限動作するところまで構築できたので、実際にあるベンチマークソフトウェアを使ってクラスター…

10. MPIクラスターを作ろう! - NFSクライアント設定

前回からのつづきです。 9. MPIクラスターを作ろう! - NFSサーバーをたてよう - 電子計算記nfs-serverというマシン名で、共有ストレージのNFSサーバーを用意しました。 次にcomputeのマシンをクライアントとして、NFSマウントします。 NFSのクライアントを…

9. MPIクラスターを作ろう! - NFSサーバーをたてよう

前回からのつづき。 8. MPIクラスターを作ろう! - ホスト設定ファイル - 電子計算記実行バイナリを共有するためにNFSストレージサーバーを準備しましょう。まずは、NFSストレージサーバー用に仮想マシンを作成します。computeのマシンと同じリージョン/ゾー…

8. MPIクラスターを作ろう! - ホスト設定ファイル

前回からのつづきです。 7. MPIクラスターを作ろう! - rsyncで実行バイナリをノード間コピー - 電子計算記複数ノードの指定には--hostを使ってきましたが、設定ファイルを用いた方法もあります。 こっちの方が実行が楽なのと、マルチコアを想定して多重で動…

7. MPIクラスターを作ろう! - rsyncで実行バイナリをノード間コピー

前回からのつづきです。 6. MPIクラスターを作ろう! - 複数ノードへスケールアウト - 電子計算記もうひとつ別のプログラムをコンパイルして実行してみましょう。(そのままだとうまく動かないので。)Wikipdediaにあるサプログラム例がMPIの勉強はじめるに…

6. MPIクラスターを作ろう! - 複数ノードへスケールアウト

前回からのつづきです。 5. MPIクラスターを作ろう! - コンパイルと実行 - 電子計算記単一ノードでMPI環境が動作することが確認できたので、これを複数ノードへスケールアウトしていきましょう。 クラウドならテンプレートを使ってどんどん複製できるので楽…

5. MPIクラスターを作ろう! - コンパイルと実行

前回からのつづきです。 4. MPIクラスターを作ろう! - 実行用ユーザー作成 - 電子計算記単体のノードでMPI環境が動くことを確認できたので、MPIのコードをコンパイルして実行してみましょう。テスト用のコードとしてHello World的なやつを用意します。ここ…